YAP-MAML2的相分離,基因表達的幕後推手!

【Journal reading】

題目:Phase separation of YAP-MAML2 differentially regulates the transcriptome

期刊:PNAS (2023)

作者:Chan-I. Chung (第一), Xiaokun Shu (通訊)

[University of California, San Francisco]

相分離(Phase separation)是當混合物的成分在某些條件下變得不相容,如濃度改變,就會發生相分離,油水分離就是一個很好的例子。而在生物體中也會發生相分離,形成生物分子凝聚體(biomolecular condensates),不同分子形成的凝聚體功能各異,一些轉錄因子也會形成凝聚體,促進轉錄活性。為了更好的了解「凝聚體」本身的影響,作者設計了一個工具,叫做SPARK-OFF,可以用非突變的方式解散凝聚體,進而研究凝聚體的功能。

本篇的主角—YAP,在人體中扮演很重要的角色,活化的yap會促進下游基因轉錄,促進細胞增生,抑制凋亡,和癌症息息相關。而在近期有研究發現,在一些癌症病患會出現YAP 融合蛋白(fusion protein)的情況,yap fusion protein是指yap和其他蛋白因為染色體易位而將Yap的n端和其他蛋白的c端連在一起,這樣的fusion protein比較不會被降解,讓yap過度活化進而造成疾病,其中YAP-MAML2融合蛋白在腦膜瘤和汗孔瘤中是最常見的,也是本篇的重點。

在此篇研究中,發現YAP-MAML2融合蛋白會形成具有轉錄活性的凝聚體,並用SPARK-OFF工具進一步發現,YAP-MAML2凝聚體比起diffuse狀態,只會上調小部分基因,並不會影響大多數的基因,但是這些被上調的小部分,卻是YAP核心調控的基因,如CYR61,顯示phase separation對於基因調控的重要性。本篇研究不僅釐清了phase separation對於YAP-MAML2轉錄活性的影響,也對研究phase separation的功能開闢新的方向。

原文連結 : https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2310430121?gad_source=1&gclid=CjwKCAiA65m7BhAwEiwAAgu4JPEOONRUOHQfMEXb2RF82kZ1bD6T686Iulf3Gp1IVmKpPqWCt-XTbhoCwbAQAvD_BwE

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